Metabolómica por espectrometría de masas: Fundamentos, diseño experimental y herramientas de procesamiento de datos
La metabolómica es la ómica más reciente y se basa en el estudio de metabolitos o moléculas de bajo peso molecular involucrados en un proceso biológico. Los análisis metabolómicos tienen flujos de trabajo y requisitos especiales tanto en las técnicas de análisis como procesamiento de datos. La metabolómica tiene grandes desafíos debido a la enorme diversidad estructural de metabolitos con grandes diferencias en propiedades químicas y físicas, así como al enorme volumen de datos generados que requieren varios pasos de procesamiento de la información como la deconvolución, alineamiento, filtrado, test estadísticos, identificación de metabolitos e interpretación biológica.
Dentro del curso se pretende dar al participante una noción integral de los fundamentos y aplicaciones prácticas de los análisis metabolómicos que le permitan identificar las posibilidades de la metabolómica para obtener información biológica relevante en diferentes áreas de la ciencia, así como planear y realizar análisis metabolómicos en sus investigaciones o en su vida profesional. Adicionalmente, el curso propuesto abordará de manera práctica el procesamiento y análisis de datos metabolómicos empleando software libre como MZmine, TidyMS y MetaboAnalyst.
Dirigido a
El curso está dirigido principalmente a estudiantes, investigadores o profesionales del área de Ciencias básicas, de la salud e ingeniería que estén interesados en aprender sobre la aplicación de la metabolómica en el estudio de la biología de sistemas. Se recomienda que el estudiante tenga un buen nivel de inglés de lectura para poder comprender los recursos y material de clase. Para este curso no se requieren conocimientos previos de programación.
Objetivos
Al finalizar el curso el estudiante tendrá una visión completa del proceso de los análisis metabolómicos desde la preparación de la muestra hasta la identificación de metabolitos; y estará en la capacidad de emplear herramientas libres como MZmine, TidyMS y MetaboAnalyst para el procesamiento y análisis de datos metabolómicos.
Metodología
El curso es un curso teórico-práctico que se realizará en modalidad Blended, en la cual el participante podrá escoger si participará de manera virtual o presencial. El curso cuenta con 16 sesiones de 90 minutos cada una, de las cuáles 10 sesiones serán prácticas. El curso será del 22 al 25 de marzo, todos los días de las 8:30 am hasta las 12:00 m y de las 2 a las 5:30 pm.
Apoyado por:
- Centro de Metabolómica – MetCore l Core Facilities l Vicerrectoria de Investigación y Creación l Universidad de los Andes l Colombia
- Escuela de Ciencias Básicas l Facultad de Salud l Universidad del Valle l Colombia
- Grupo de investigación de Espectrometría de Masas Bioanalítica l CIBION - CONICET l Argentina
- CABANA - Capacity strengthening project for bioinformatics in Latin America.
Contenido
- INTRODUCCIÓN A LA METABOLÓMICA (Sesiones teóricas):
- Introducción y conceptos generales en metabolómica
- Flujos de trabajo en los análisis metabolómicos
- DISEÑO EXPERIMENTAL Y CONTROL DE CALIDAD (Sesiones teóricas):
- Diseño experimental
- Control de calidad de los análisis metabolómico
- QA & QC.
- TÉCNICAS DE ANÁLISIS METABOLÓMICOS (Sesiones teóricas):
- Introducción y conceptos generales de técnicas analíticas aplicadas a la metabolómica basadas en espectrometría de masas de alta resolución
- PROCESAMIENTO Y ANALISIS DE DATOS METABOLÓMICOS (Sesiones teóricas y prácticas):
- Introducción al procesamiento de datos metabolómico
- Pre-procesamiento de datos: deconvolución, alineación, integración y filtración
- Análisis de datos: filtrado de datos, normalización, escalado, transformación
- Análisis estadístico en metabolómica
- Sesiones prácticas usando software libre como MZmine, TidyMS, MetaboAnalyst.
- IDENTIFICACIÓN DE METABOLITOS (Sesiones teóricas-prácticas):
- Introducción a la identificación de metabolitos
- Niveles de identificación de metabolitos
- Identificación putativa y análisis de MS/MS.
- ANÁLISIS DE RUTAS BIOLÓGICAS (Sesiones teóricas-prácticas):
- Interpretación biológica de los análisis metabolómico
- Herramientas para el mapeo de rutas biológicas alteradas.
Profesores
Condiciones
Eventualmente la Universidad puede verse obligada, por causas de fuerza mayor a cambiar sus profesores o cancelar el programa. En este caso el participante podrá optar por la devolución de su dinero o reinvertirlo en otro curso de Educación Continua que se ofrezca en ese momento, asumiendo la diferencia si la hubiere.
La apertura y desarrollo del programa estará sujeto al número de inscritos. El Departamento/Facultad (Unidad académica que ofrece el curso) de la Universidad de los Andes se reserva el derecho de admisión dependiendo del perfil académico de los aspirantes.
