Biología Sintética: Diseño y Construcción de Sistemas Biológicos Programables.

Curso

Biología Sintética: Diseño y Construcción de Sistemas Biológicos Programables.

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Biología Sintética: Diseño y Construcción de Sistemas Biológicos Programables.

Este curso en biología sintética es fundamental para cualquier profesional interesado en estar a la vanguardia de la biotecnología moderna, ya que aborda el diseño y construcción de sistemas biológicos programables, una tecnología clave en áreas como la medicina, la agricultura, y la industria. La biología sintética está revolucionando la forma en que creamos soluciones biotecnológicas, permitiendo el desarrollo de nuevos medicamentos, biocombustibles y biosensores. Cursarlo brindará una actualización integral en un campo de rápido crecimiento, proporcionando herramientas y conocimientos para enfrentar los desafíos científicos y tecnológicos del presente y del futuro. 

Al finalizar el curso, el estudiante será capaz de diseñar y ensamblar circuitos genéticos, crear sistemas biológicos sintéticos y aplicar estos conocimientos en contextos industriales, ambientales y médicos. Además, el curso se distingue por su enfoque práctico, que incluye simulaciones y actividades en laboratorio, permitiendo que los participantes adquieran experiencia directa en la construcción de circuitos genéticos. Este enfoque multidisciplinario y aplicado asegura una formación completa y competitiva en un área de gran demanda global. 

El diferencial de este curso radica en su metodología práctica y aplicada, que combina teoría avanzada con simulaciones y actividades en laboratorio, permitiendo a los estudiantes adquirir experiencia directa en el diseño y construcción de sistemas biológicos sintéticos. Además, se enfoca en temáticas coyunturales y emergentes, como el uso de tecnologías de edición genética (CRISPR/Cas) y la creación de organismos programables, lo que lo posiciona a la vanguardia de las tendencias globales en biotecnología. 

Otro aspecto clave es la experiencia de los profesores, quienes son expertos en biología sintética y biotecnología, con proyectos y publicaciones reconocidas en el ámbito científico. Su enfoque multidisciplinario y conocimiento de las aplicaciones industriales y médicas actuales ofrecen una formación que va más allá de lo académico, conectando la teoría con casos de estudio reales y oportunidades del mundo profesional. 

Este curso hace parte del programa Biología Molecular Aplicada: Innovación en Edición Genética y Biotecnología. Ver más aquí.

Dirigido a

El curso está dirigido a profesionales y estudiantes avanzados en áreas como biotecnología, bioingeniería, ciencias biológicas, ingeniería genética, microbiología o química, interesados en desarrollar competencias en el diseño y construcción de sistemas biológicos sintéticos. Puede ser de particular interés para quienes ocupen cargos como investigadores, ingenieros de bioprocesos, técnicos de laboratorio, o especialistas en biotecnología industrial y desarrollo de productos biofarmacéuticos. 

Requisitos: El nivel educativo mínimo recomendado es pregrado en ciencias biológicas o áreas afines, y no se requiere una experiencia extensa, aunque es preferible tener conocimientos básicos en biología molecular, genética y manejo de cultivos celulares. Prerrequisitos sugeridos incluyen un manejo elemental de técnicas de clonación y edición genética, pero el curso proporcionará los recursos necesarios para adquirir estas habilidades a medida que se avanza en el contenido. 

Objetivos

Al finalizar el curso, el estudiante estará en capacidad de: 

  1. Diseñar circuitos genéticos modulares y funcionales utilizando herramientas y metodologías de biología sintética. 
  2. Ensamblar y modificar organismos vivos, como bacterias y levaduras, para cumplir con funciones específicas. 
  3. Simular el comportamiento de sistemas biológicos programables utilizando software especializado para predecir su funcionamiento en diversos contextos. 
  4. Optimizar procesos de producción de compuestos de valor añadido (como biofármacos o biocombustibles) en sistemas biológicos sintéticos. 
  5. Evaluar la eficiencia y seguridad de los sistemas biológicos diseñados, considerando aspectos éticos y regulatorios. 
  6. Aplicar los principios de la biología sintética en proyectos de innovación en áreas como la medicina, la industria y el medio ambiente. 
  7. Integrar conocimientos de biología molecular, ingeniería genética y biotecnología para desarrollar soluciones biológicas a problemas específicos en campos industriales y científicos. 

Metodología

El curso de biología sintética está diseñado con un enfoque teórico-práctico que combina clases interactivas con actividades experimentales en laboratorio. La metodología promueve un aprendizaje activo y participativo, donde los estudiantes integran los conocimientos teóricos con experiencias prácticas para fortalecer su comprensión y habilidades en el diseño y evaluación de circuitos genéticos y sistemas biológicos sintéticos. 

  1. Clases Teóricas Interactivas (50% del curso): Las sesiones teóricas proporcionan los conceptos fundamentales de la biología sintética. A través de presentaciones dinámicas, estudios de casos y debates, los estudiantes comprenderán los principios clave, como el diseño de circuitos genéticos y el uso de herramientas de edición genética. Estas clases están diseñadas para fomentar la participación activa de los estudiantes, alentando preguntas, discusiones y la resolución colaborativa de problemas. Se utilizarán ejemplos reales de aplicaciones industriales y médicas de la biología sintética para contextualizar el contenido. 
  2. Actividades Experimentales en Laboratorio (50% del curso): Las sesiones prácticas permitirán a los estudiantes poner en acción los conceptos aprendidos mediante la manipulación directa de organismos y circuitos genéticos en el laboratorio. Estas actividades incluyen la construcción de circuitos genéticos usando BioBricks, la transformación de organismos modelo como bacterias y la evaluación experimental de la expresión y comportamiento de los circuitos bajo diferentes condiciones. Los estudiantes trabajarán en equipos para realizar experimentos en un entorno controlado, promoviendo el desarrollo de habilidades técnicas y colaborativas. 
  3. Simulación y Diseño de Proyectos: A lo largo del curso, los estudiantes participarán en el diseño y simulación de circuitos genéticos mediante software especializado. Aunque la parte práctica del curso se centra en experiencias de laboratorio, las simulaciones permiten predecir y planificar el comportamiento de los sistemas biológicos antes de realizar los experimentos. Los estudiantes trabajarán en el desarrollo de un proyecto final, en el cual diseñarán y planificarán un sistema biológico sintético para una aplicación real (médica, industrial o ambiental), integrando todos los conocimientos adquiridos.

Contenido

Sesión 1

- Fundamentos y Principios de la Biología Sintética 

Objetivos: Introducir los conceptos básicos y la importancia de la biología sintética.

Temas:

• Historia y evolución de la biología sintética.

• Diferencias entre ingeniería genética tradicional y biología sintética.

• Diseño modular y estandarización de componentes biológicos.

• Introducción a los circuitos genéticos y sistemas biológicos programables.

• Ética y aspectos regulatorios en la biología sintética.

Sesión 2 Sesión práctica:

Búsqueda y análisis de ejemplos de circuitos genéticos básicos en bases de datos públicas (BioBricks, Registry of Standard Biological Parts).

Sesión 3

- Diseño de Circuitos Genéticos 

Objetivos: Desarrollar habilidades para diseñar y ensamblar circuitos genéticos modulares.

Temas:

• Principios de diseño de circuitos genéticos: promotores, represores, operones y amplificadores.

• Herramientas y software de simulación de circuitos biológicos 

• Circuitos lógicos biológicos: puertas AND, OR y NOT.

Sesión 4 Sesión práctica: 

Diseño y simulación de un circuito genético simple en software, ajustando las variables para observar su comportamiento en diferentes condiciones.

Sesión 5

- Herramientas de Construcción de Organismos Sintéticos

Objetivos: Adquirir competencias en la edición genética avanzada y la creación de sistemas biológicos sintéticos.

Temas:

• Técnicas de clonación molecular y construcción de plásmidos.

• Estrategias de ensamblaje modular: Golden Gate y BioBricks.

• Modificación genética de bacterias y levaduras para expresar circuitos sintéticos.

• Optimización de condiciones de cultivo para organismos sintéticos.

Sesión 6

- Aplicaciones Industriales, Médicas y Ambientales de la Biología Sintética

Objetivos: Aplicar los principios de biología sintética en proyectos reales y explorar sus aplicaciones en diversas áreas.

Temas:

• Biología sintética en la medicina: biosensores, terapias génicas y producción de biofármacos.

• Aplicaciones industriales: producción de biocombustibles, bioquímicos y biomateriales.

• Soluciones ambientales: biorremediación y captura de carbono con organismos sintéticos.

• Futuras tendencias en biología sintética y sus impactos en la industria.

Sesión 7 Sesión práctica: 

Ensamble experimental de piezas estandarizadas de BioBricks utilizando técnicas de clonación molecular.

Sesión 8

- Proyecto Final de Diseño de Organismos Sintéticos

Objetivos: Integrar los conocimientos y habilidades adquiridos para desarrollar un proyecto de biología sintética.

Temas:

• Etapas de diseño de un proyecto en biología sintética.

• Evaluación de viabilidad, riesgos y aspectos regulatorios.

• Presentación y justificación de la propuesta de un organismo sintético para una aplicación específica.

• Herramientas de planificación experimental y simulación.

Sesión 9 Sesión práctica: 

Desarrollo de un proyecto grupal donde los estudiantes diseñarán un organismo sintético para una aplicación médica, industrial o ambiental. Incluye simulación del comportamiento del sistema biológico programado.

Sesión 10 Sesión práctica: 

Evaluación del comportamiento y la eficiencia de un circuito genético bajo diferentes condiciones experimentales.


Profesores

María Francisca Villegas

Microbióloga de la Universidad de los Andes, con doctorado en Ingeniería Bioquímica de UCL, UK. María Francisca lleva más de 5 años en docencia en el área de bioquímica y el estudio del metabolismo microbianos en procesos industriales.

Adriana Bernal

Profesora de cátedra en el Departamento de Arte de la Universidad de los Andes. Es Comunicadora Social de la Universidad Javeriana con énfasis en comunicación audiovisual y educativa. Después de trabajar por dos años en FOCINE, el antiguo Instituto de Fomento Cinematográfico, viajó a realizar estudios de Dirección de Fotografía en la prestigiosa Escuela Nacional de Cine Francesa, FEMIS, y fue pionera en su campo, al abrir las puertas de su profesión para las mujeres en Colombia. Después de haber trabajado en Francia, en Canadá y en Suiza, (Dos largometrajes y alrededor de 30 cortos), Adriana Bernal se estableció en su país como Directora de Fotografía, Comunicadora Audiovisual y docente.

Darcy Damary Rincón

Microbióloga y Magíster en Diseño de la Universidad de los Andes. Me gusta astrobiología por lo que realicé una opción en astronomía en mi pregrado. Mi trabajo e investigación en Biodiseño se centra en biomateriales a partir de bacterias modificadas genéticamente, microhongos, macrohongos y algas, su para aplicación en contextos industriales; innovación social participativa en comunidades rurales alrededor de bioeconomías y la generación de talleres STEM (ciencias, tecnología, ingeniería y matemáticas) enfocados en la democratización de la ciencia y la tecnología en colegios públicos del país. Estoy interesada en fomentar interacciones y lenguajes que facilite la interdisciplinariedad, especialmente mediante el diseño de cursos que cruzan las fronteras entre departamentos como Diseño, Arquitectura, Ciencias Biológicas e ingenierías. Hago parte del BioArqDis en donde desarrollamos diferentes actividades como, talleres de biodiseño abiertos a todas las disciplinas que permitan fomentar el desarrollo creativo desde la interdisciplinariedad y coordino los espacios de trabajo en biodiseño para los estudiantes de ArqDis en los laboratorios especialmente de ciencias biológicas. Lidero un semillero centrado en procesos de investigación, innovación y creación en Biodiseño.

Andrés Fernando González Barrios

Ingeniero Químico, MSc y PhD en Ingeniería Química. Profesor Asociado del Departamento de Ingeniería Química de la Universidad de los Andes. Investigador enfocado al diseño de productos y mejoramiento de procesos en la industria de alimentos.

Eventualmente la Universidad puede verse obligada, por causas de fuerza mayor a cambiar los profesores presentados en este documento.

Condiciones

Eventualmente la Universidad puede verse obligada, por causas de fuerza mayor a cambiar sus profesores o cancelar el programa. En este caso el participante podrá optar por la devolución de su dinero o reinvertirlo en otro curso de Educación Continua que se ofrezca en ese momento, asumiendo la diferencia si la hubiere.

La apertura y desarrollo del programa estará sujeto al número de inscritos. El Departamento/Facultad (Unidad académica que ofrece el curso) de la Universidad de los Andes se reserva el derecho de admisión dependiendo del perfil académico de los aspirantes.